Вот как-то так оно и монтировало корень для записи.
ИМХО, лучше воспользоваться udisks-glue, заодно и всякие диалоги выбора файлов не будут путаться между якобы несмонтированным /dev/sdXY и таинственным mountpoint'ом в /media/, про который они ничего не знают.