Шифрование pdf-файлов

pdftk вроде это умеет, хотя сам я подобным не пользовался.

Эээ, gpg, truecrypt?

jpdftweak

но ведь существует как минимум 10 ломалок для PDF, какой смысл?

Хосподя-я, а это то тебе зачем? Ну ладно запрет печати, а ещё и просмотра. Сунь файл в архив под паролем и всего делов.

man openssl?

Формат PDF хоть эту фичу (запрет печати и т.п.) и поддерживает, но это элементарно выпиливается правкой сырцов xpdf (и производных).

Возникла потребность в шифровании(запрет просмотра/печати) нескольких pdf-файлов. Какую программу посоветуете?

GnuPG.

В нормальных просмотрщиках (okular) ничего править не нужно - уже есть отдельная настройка «игнорировать drm».

Если файл зашифрован и не открывается без ввода пароля, как ты собираешься «игнорировать drm»?
Здесь тестовый запаролированный pdf-файл

Advanced PDF Password Recovery (APDFPR) - Процесс нахождения ключа занимает около 3-4 дней в зависимости от скорости компьютера.

Вообще речь шла о

запрет просмотра/печати

я, в частности, ответил про запрет печати.