Не могу писать в домашней директории.

gentoo

ССЗБ

$ ls -alF ~
# df -h

Потому что нет места (для рута есть резерв на ext*)

tune2fs -m 0

покажи
df -h ~
и
df -i ~

Говорит, что нет места. От рута пишет нормально. Система gentoo.

А ФС наверное одна из ext2/ext3/ext4? Значит закончилось место выделенное для пользователей, остался только резерв для root-а(обычно 5% от емкости ФС). Изменить значение можно через tune2fs, как уже посоветовали выше

Удали всё в /var/tmp/portage/
Наверняка у тебя там залежи ошмётков компилирования.