Железо для «научных» вычислений.

mathlab c CUDA эффективно работает.

А если взять облачный сервис для вычислений? Самое-то бы вышло.

гпу, облачные сервисы и кластеры не рассматриваются.

Насколько много тебе надо производительности? Какие объёмы числодробления? Режим работы? И да, я бы больше о GPU думал, для числодробления (хотя от характера задач зависит). Может что-то из профессионального GPU, где с плавающими числами погрешности поменьше.

Вопрос в том не просядет ли производительность при более чем одном сокете.

Оперативной памяти добавь, если хочешь заниматься моделированием (comsol и т.д.). До 32, минимум.

Насколько много тебе надо производительности?

в чем она меряется?
матлаб не сильно требователен.
комсол пока жрет до 10 Гб. по процессору чем быстрее тем лучше?
по openMP (шуршит 2-е суток на i5 с 4 core) это:

#pragma parallel for 
for (i=0; i<1e4; ++i)
{
    thread thr(function, parameter[i]);
    thr.join();
}

void function(parameter[i]) 
{
#pragma parallel for 
for (j=0; j<1e7; ++j) {
    new_function(parameter[i]);
}

то что он любит память это видно.
32 это если 3D (пока в нем не нуждаюсь) или параметрические исчисления.
это такое, что можно всегда добавить.

если то, что соберу, оправдает себя за год, дальше будет финансирование на xeon phi.
на GPU смотрю сквозь пальцы.
но это все не то!
вопрос в теме не о GPU и других вещях.

ASUS ROG RAMPAGE V EDITION 10 [600]
Intel Core i7 6900K - 3.2 GHz - 8-Core - 16 Threads - 20 MB Cache [1200]
G.Skill Ripjaws V - DDR4 - 16 GB : 2 x 8 GB - DIMM 288-PIN - 3200 MHz / PC4-25600 [120]

vs

SUPERMICRO X10DRI-LN4+ [600]
Intel Xeon E5-2650V3 - 2.3 GHz - 10-Core - 20 Threads - 25 MB [1200]
G.Skill Ripjaws V - DDR4 - 16 GB : 2 x 8 GB - DIMM 288-PIN - 3200 MHz / PC4-25600 [120]

vs

SUPERMICRO X10DRI-LN4+ [600]
Intel Xeon E5-2650V3 - 2.3 GHz - 10-Core - 20 Threads - 25 MB [1200]
G.Skill Ripjaws V - DDR4 - 16 GB : 2 x 8 GB - DIMM 288-PIN - 3200 MHz / PC4-25600 [120]
2 X Intel Xeon E5-1650V3 - 3.5 GHz - 6-Core - 12 Threads - 15 MB [2 x 700]

На мой дилетантский взгляд, вариант №2. Но памяти я бы добавил. Никогда не знаешь, когда захочешь запустить модель побольше. Тем более, она стоит мало, по сравнению с другими компонентами.

Как софт по количеству потоков масштабируется против их скорости?

i7-6950X+самая дешёвая мать будет быстрее твоих вариантов.

ASRock X99 Extreme3 например.

тоже ничего не понимать,
но тесты лолоклокеров говорят что i7 ****K имеют самые быстрые ядра.

но нужен комп для comsol, matlab и особенно openMP.

Но все всё про софт знают лучше ТС.

Если собираешься считать сутками, то кмк имеет смысл брать память ECC (соответственно, процессор и матплату с его поддержкой).

Знакомый хотел сэкономить и задействовал небольшой самодельный кластер из машин компьютерного класса в институте во время каникул. Считал что-то полуинженерное по распределению поля в волноводах, занимало 1-2 суток. В результате из-за ошибок памяти у него часто была каша вместо результатов.

Я не говорю, что у тебя такое точно будет (не особо в курсе comsol; в каких-нибудь методах частиц наверн можно забить), но задуматься стоит. Почитай про вероятности ошибок оперативной памяти.

Всё сильно зависит от задач. Но если есть матричные вычисления в большом кол-ве - нужна CUDA на видеокарте (OpenCL довольно плохо поддерживается сейчас в прикладных либах, поэтому AMD потребует дополнительных вложений работы в код).

На мой взгляд - бери i7 без индекса K (К процы это для оверклокеров, вы же гнать его не будете, чтобы ресурс не убить) или Xeon влазащий по деньгам. 16 Gb DDR4 от Samsung или Kingston двумя плашками по 8 Гб. Мать - что-то из среднего ценового диапазона (а не какой-то Rampage, как советует идиот выше, Rampage это для разгонов и понтов, тебе не нужно).

По деньгам считай так, чтобы осталось где-то 20к рублей на 1060 с 6 Гб памяти, если сможешь уложиться в меньший бюджет на проц+мать+память, то беги 1070 (30к)\1080 (50к).

P.S. Не забывай, что под нагрузки тебе нужен качественный блок питания + не стоковый кулер на проц.

Чтобы задейчтвовать полностью 4x канальный контроллер памяти нужно 4 планки. Алсо ты ОПа идиотом назвал))

И ещё: у -K процев выше частоты с завода, их не обязательно гнать.

Я сказал правду. Две планки - через год ему 16 перестанет хватать (или раньше).

Про k процы - ему видеокарта будет на порядок полезнее чем k проц. Я сравнивал dgemm на своих i5 4670k и r9 290 - gpu на порядок больше производительности выдает в ViennaCL.

ядра всего 4, а прагм натыкал во все циклы. это во-первых. а во-вторых, зачем тебе тут потоки, если ты используешь openmp? а join ты тут поставил потому, что без него всё вообще тормозит, да?

а что в функции? сколько там ещё вложенных циклов?

а simd используешь? а то может забесплатно можно раза в 4 ускориться.

Вусрачку разогнанную память для вычислений брать нельзя.

Два проца можно брать только если знаешь что такое NUMA.

ок. прочитав все сообщения, можно сделать вывод (который большинство посчитает неправильным?) что:

SUPERMICRO X10DRI-LN4+ [600]
Intel Xeon E5-2650V3 - 2.3 GHz - 10-Core - 20 Threads - 25 MB [1200]
Kingston ValueRAM - DDR4 - 32 GB : 4 x 8 GB - DIMM 288-PIN - 2133 MHz / PC4-17000 - CL15 - 1.2 V - ECC [300]

это лучший вариант за такую цену.
RAM с ECC и частотой 2133, что бы не было ошибок.
2-х процесорная мамка, с одним процом же работать будет? потом прикупиться другой если что.
так никто не ответил. i7 в паре работать умеют? или только Xeon?

Вусрачку разогнанную память для вычислений брать нельзя.

на счет RAM понял, исправил.

Два проца можно брать только если знаешь что такое NUMA.

ну у нас стоят два компа с процами xeon.
никто не знает что такое NUMA, но они работают, и пошутрее остальных.

Два зеона на одной материнке стоит? Неправильно написанный код на них будет конкретно тупить. Между контроллерами памяти процессоров не должно быть большого обмена данными.

да. 2. на них стоит оффтопик. matlab с comsol. и им уже более 5 лет.
openMP matlab с comsol только на ноуте i5 и openMP на кластере. но кластер это очередь, всегда по Х задач крутится и так далее.
повторюсь. собираем железо.
кривые руки для кодинга не обговариваются. хотя они перечеркивают все преимущества железа.

последняя комплектация нормальная? ничего не противоречит в сборке?

Комплектация нормальная, мамка с одним процом работать будет, не будут работать некоторые разъемы на ней.

гпу

Почему?

Зависит от задачи, но Xeon Phi — отстой, GPU, в принципе, тоже. Бери Intel Xeon, и твои волосы будут гладкими и шелковистыми

ничего не хочется переписывать.
openMP схватит автоматом GPU? без перезаписи кода? если да. можно всунуть.
но насколько я знаю, не подхватывает.

matlab c comsole - им хватит и того, что предложено.

все. тема закрыта. спасибо всем за участие.

ИМХО дельные советы. Супермикро хоть и дороже иногда чем другие платформы, но у неё заточенность именно под серверы и числодробилки. Основное правило по железу для научных вычислений: памяти много не бывает. И если это многосуточные задачи, то память только ECC. А дальше частности: поддаются расчёты GPU - смотри видеокарты или сопроцессор типа xeon Phi.

Конкретно на год: возьми память ECC. Думаю, при ограничении в 2 тысячи евро на 32 гига денег не хватит.

Есть Xeon E5-2650v4. Цена такая же как у v3, но на 2 ядра и 5 MB кеша больше.

https://www.computeruniverse.ru/products/90622911/gigabyte-mu70-su0.asp

в ViennaCL

А если дропнуть нафиг ViennaCL и взять хотя бы clBLAS/CLBlast...

*извините, мимопроходил*

Не увидел для clBLAS бенчмарков сравнения CPU и GPU (у ViennaCL они есть). Писать сейчас самому - нет времени и желания (я использую OpenCL как бекэнд для пары операций с матрицами и в чистый BLAS не лезу просто).

А не проще ли пошуршать по барахолкам и найти ноду какого-нибудь старого кластера?

может и проще и дешевле.
но, по барахолкам можно официально что-то протянуть?
да и объяснить начальству будет тяжело, не поймут.

с последнего:
Stalin все правильно подчеркнул,
а iliyap посоветовал получше проц.

Ааа, у тебя НИИ =\

А бюджет какой, чё тогда не E7-8890 v4 24ядра 48потоков и та же частота.

Можно. На той же авите немало юрлиц б\у торгуют. Даже типа с гарантией (на честном слове).

ок. но мне это не подходит.

бюджет резиновый.
себя ограничил суммой, указанной выше.
за ~7000, наверное, проще взять Xeon Phi? не так ли?

ну и нахрена десктопную говнопамять с гламурными радиаторами, погнанную по самое нехочу, на серверные платы пытаться втулить? все равно с большой вероятностью не заработает вообще, а если заработает - то на низких частотах...

Гм.

А тебе точно нужен серверный вариант?

Минусы:
1. память специфичная, просто пойти в магаз и купить не получится
2. NUMA — снижение производительности, или придется прогать с учетом железа...
3. Серверные материнки не супер с т.з. втыкания нескольких GPU (матлаб на них действительно неплохо считает)
...

Я бы предложил рассмотреть стандартный вариант с хорошим core i7 и обычной материнкой на 128Gb DDR4.

Если мощности не хватит, то купить еще один (два, три,...) точно такой же. Если, конечно, у тебя задачи позволяют распределять вычисления.

++

Всё таки у phi своя специфика, оно заточено под использование avx512. А то обычный проц.