в общем такая проблема.. У меня материнская плата gigabyte GA90XT. По моему так. И винт, который стоит на ide0, мастер. Вроде бы раньше никогда проблем не было. И сейчас во фрибсд например проблем нет. Ядро 2.4.19, vanilla без всяких патчей. Самоскомпилированное -- это первое линуксовское ядро которое я скомпилировал, так что я вполне мог важную вещь упустить.
Теперь сам симптом -- иногда после обращения к диску, проще всего у меня получалось повторить это если я в баше нажимаю таб. Так вот после обращения, лампочка на винте не гаснет, а горит еще секунд 5-20, при этом дисковой активности вроде нет.
Пока у меня одно совсем идиотское предположение, не может ли это как-то быть вызвано интерференцией:) прерываний от клавиатуры и винта, потому что по моему все разы когда я это наблюдал была активность клавиатуры.