Я правильно понимаю, что генерируемые initramfs заточены на открытие только одного LUKS? Схема с несколькими PV, некоторые из которых зашифрованы, деградирует, придётся следить за расположением / и /usr, dm-raid тоже пролетает?
Самому можно настроить как угодно. Вопрос пока про genkernel, dracut и прочие.