Винт дергается раз в секунду.

Один из способов, который можно попробовать: прописать noatime в fstab.

http://gentoo-wiki.com/MAN_mount_8

С другой стороны, надо смотреть, какие демоны как часто логи пишут.

>Программист я, не админ. Можно сказать - чайник :-)))

ну хоть один честно признался, респект!

> Примерно раз в секунду дергается винт. Как будто в лог кидается сообщение. Раздражает.

Запись на диск происходит при заполнении кеша жесткого диска, так что дело не в этом.

У меня диск на ноуте примерно раз в 20 секунд так характерно щелкал. В гугле нашел решение проблемы - отрубание агрессивной политики энергосбережения, hdparm -B 255 /dev/hda

в Fedore 8 похожая ситуация была. Писало в /var/log/messages ровно раз в секунду Warning....... Оказалось- глюк ноута(Inspiron 1501). Но кое-как вылечил :)