Попробую проявить свои телепатические способенности :)
Насколько я поняла из /usr/src/linux/Makefile:
751 _modinst_post: _modinst_
752 if [ -r System.map ]; then $(DEPMOD) -ae -F System.map $(depmod_opts) $(KERNELRELEASE); fi
Значит, либо не выполняется depmod, либо недоступен для чтения System.map, в общем исходи из одной этой команды. От root'а хоть make выполняешь? Похоже, да, иначе бы ошибка была еще на этапе _modinst_