Перевернуть видео

man ffmpeg

Вообще, как уже подсказали ffmpeg. Могу также посоветовать Avidemux.

Преобразование видео.

Спасибо, забыл про avidemux. Интерфейс 3,14 какой неудобный, но делает свое дело.
Кстати, в VLC, оказывается, можно настроить воспроизведение так, чтобы он это видео каждый раз открывал повернутым как нужно, не изменяя при этом сам файл.