Правильно ли я понимаю, что вот эта штука нужна только для шифрования бекапов:
https://git-annex.branchable.com/encryption/
https://git-annex.branchable.com/design/encryption/
https://git-annex.branchable.com/special_remotes/
а зашифровать целиком репозиторий или указанные файлы из репозитория нельзя?