GUI-only, типа kdiff не интересуют впринцыпе — Мне нужно скриптовать.
RCS merge слишком примитивен. Хотелось бы что-то более продвинутое для 3-WAY merge.
Внутренние алгоритмы git-merge куда более продвинуты чем RCS merge, но я не встречал их реализацию отдельной тулзой.
Решать конфликты предполагается вручную, другими инструментами.