Почему бы им не объединиться в один общий проект?
Сделать там команду Gentoo/Haiku (то есть, portage, используемый в Haiku), сделать другое корневое дерево, а остальные репозитории взять как есть. Весь GNU-софт мог бы собираться единообразно.
Что мешает?