LINUX.ORG.RU
ФорумTalks

[ЖЖ] OpenSource (and Unix-like systems, on the whole) & science

 


0

0

По работе занят изучением горизонтального переноса генов у прокариот. И вот по ходу работы интересуюсь тем, что уже сделано. Обнаружил некий сайт: http://www.genomics.ceh.ac.uk/orphan_mine/qipp_web.php?ver=

На данном сайте используется и выложена программа для сравнения генов (геномов). Каково же было мое удивление, когда обнаружил, что программа не просто выложена, а еще и с исходниками! Мало того, так это еще и перл-скрипт!

=> в научном мире живы еще традиции OpenSource и живо использование Unix-систем и инструментов в этих системах.

P.S. Вертикальный перенос генов - это от родителей к потомкам, а горизонтальный - это меж теми, кто (пишу "кто", а на самом деле бактерии "что") не состоит в подобных отношениях.

★★★★★

Удивись еще больше, таких программ дофига и больше, правда не так много среди них исходников под GPL или BSD like лицензиями.

Fredy
()
Ответ на: комментарий от Fredy

Именно сравнение по методу QIPP?

hibou ★★★★★
() автор топика

> P.S. Вертикальный перенос генов - это от родителей к потомкам, а горизонтальный - это меж теми, кто (пишу "кто", а на самом деле бактерии "что") не состоит в подобных отношениях.

То есть макофилы плодятся с горизонтальной позиции?

Gharik
()

Есть много всяких скриптов, в основном для генетики и молекулярной биологии. Гуглите на тему bioperl и biopython.

ptarh ★★★★★
()

но qipp то работает?

sid350 ★★★★★
()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.