В последних версиях Adobe Reader есть возможность комментировать pdf (довольно удобно при рецензировании текста и рецензенту, и рецензируемому). Я уж было обрадовался, но как выяснилось, чтобы эту возможность включить (разрешить добавлять комментарии) нужен платный Adobe Acrobat.
P.S. В TeX Live 2009 есть стандартный пакет pdfcomment который позволяет добавлять pdf-комментарии в исходнике, но для этого корректор должен понимать что такое LaTeX, что в наших реалиях не шибко распространено.