LINUX.ORG.RU
решено ФорумTalks

Поясните - что за «генетическая информация» опубликована здесь: https://github.com/msporny/dna ?


0

1

Мой английский не позволяет это понять.
====
https://github.com/msporny/dna:

Manu Sporny's genetic information (roughly 1 million SNP markers) — Read more
http://manu.sporny.org/
...
This git repository contains the genetic information for Manu Sporny
extracted using the Illumina OmniExpress Plus Genotyping Beadchip.
...
====
Чип какой-то ... не понимаю ...

★★★★★

Он свой генетический код выложил, и теперь можно дружно его исправлять в виде исходников.

Quasar ★★★★★
()

А чего непонятного-то? Человек выложил результат сканирования своего ДНК... так сказать, релизнулся в опенсорс. лицензия - Creative Commons.. можно делать деривативы...

gods-little-toy ★★★
()
Ответ на: комментарий от gods-little-toy

> лицензия - Creative Commons.. можно делать деривативы...

Если лицензия окажется совместимой с законодательством страны, где производить потомство.

pacify ★★★★★
() автор топика
Ответ на: комментарий от Mitsumi

Уже форкнули. Там в комментариях есть.

Quasar ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от StrongDollar

> меня интересуют только чипы - их стоимость и где приобрести.

Ни полнота сканирования (все ли гены), ни достоверность, ничего другого не интересует?

Ты, наверно, собрался открыть центр типа сканирования днк для всех желающих? «Вышей свой ДНК на футболке»...

gods-little-toy ★★★
()

Так это не он должен был выкладывать, а его родители. На правах авторов.

proud_anon ★★★★★
()

О! Потом, если вдруг копирасты набигут, можно будет встроить в картошку пару открытых генов под GPL3 и свободно ее распространять.

abraziv_whiskey ★★★★★
()

Ребята! Помогите мне сконпелировать сорцы, а то чота не могу ничо сделать, ни configure ни makefile не видно. Как это собирать?!

Giver
()
Ответ на: комментарий от Giver

Надо яйцеклетку. Вынимаешь из нее ядро, ставишь туда эту ДНК, запихиваешь обратно. Инсталлируешь в матку, ждешь пару недель (в зависимости от производительности системы, может быть и дольше).

abraziv_whiskey ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от abraziv_whiskey

1. Сделать ГМО-картошку, запатентовать код.
2. Распространить её так, чтобы другйо картошки, кроме ГМО, не осталось в природе
3. собирать отчисления с каждой картофелины
4. ???????
5. PROFIT!

OramahMaalhur
()

Можно запилить социальную сеть, где вся информация, вроде интересов и фотографий, будет создаваться парсером ДНК.

vurdalak ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Giver

Этим занимается только институт Крейга Вентера.

anonymfus ★★★★
()
Ответ на: комментарий от Mitsumi

Может форкнуть его ?

Думаю, жена его тебе по башке настучит, если ты его форкнешь.

Black_Shadow ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Quasar

Написал патч для шестирукости. Как замерджить в апстрим?

Smacker ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Kosyak

К стати да. Присоединяюсь к вопросу )

Siado ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от OramahMaalhur

> 2. Распространить её так, чтобы другйо картошки, кроме ГМО, не осталось в природе

2. Заставить ее распространяться, заражая все вокруг своими генами, чтобы других растений, кроме ГМО, не осталось в природе

Fixed.

amomymous ★★★
()
Ответ на: комментарий от Giver

>Ребята! Помогите мне сконпелировать сорцы, а то чота не могу ничо сделать, ни configure ни makefile не видно. Как это собирать?!

Ждём ебылдов:)

sdh
()
Ответ на: комментарий от Quasar

Он свой генетический код выложил, и теперь можно дружно его исправлять в виде исходников.

Компилятор закрытый, хардвер огороженный :)

Xenesz ★★★★
()

>Чип какой-то ... не понимаю ...

Чип в данном контексте это подложка из стекла к которой лазером прифигачена одноцепочечная ДНК. Далее чип промывают раствором содержащем другую одноцепочечную ДНК/РНК с меткою (флюоресцентной или радиоактивной) и если последовательности комплиментарны то образуется двуцепочечная РНК и ячейка после промывки начинает светиться

SNP это однонуклеотидный полиморфизм, то есть участки которые у разных людей отличаются ровно на один нуклеотид. Изучение этих SNP - модная технология исследования предрасположенности к разным болезням. Но тут есть свои косяки о которых можно говорит долго. В общих чертах наличие одинаковых SNP у разных людей в большинстве случаев лишь свидетельствует о дальнем родстве, не факт что они связаны непосредственно с болезнью, дефектный ген может находится рядом (или не находиться, в этом случае будет ложная тревога). Хотя некоторые довольно тяжелые болезни вроде серповидной клеточной анемии вызываются мутаций в одном нуклеотиде, в этом случае SNP будет не маркером а действительно причиной болезни

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от DNA_Seq

и да, чип называется так потому что на одной подложке тысячи ячеек, обычно данные представляют в виде «тепловой» карты где каждая ячейка представлена квадратиком, чем сильнее светится тем краснее на диаграмме, а вот ячейки без свечения на карте «холодные», синие

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от DNA_Seq

Для анализа данных с таких чипов есть даже библиотека для R - bioconductoR

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от Quasar

Там не генетический код, там данные с чипа, то есть это должна быть таблица последовательность - уровень свечения с миллионом записей

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от Giver

>Это все понятно, но чем мне сам код в днк сконпелировать?

Химическим синтезом. Одно основание примерно один бакс а их четыре миллиона. Ну и умножает на 10 с учетом сборки

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от Giver

Пофапай, читая этот код. То, что в итоге выйдет, надо инсталлировать в женский организм. Дальше просто жди.

LongLiveUbuntu ★★★★★
()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.