Сколько биологии нужно для биоинформатики?

cast DNA_Seq

Желаю заниматься биоинформатикой. По образованию физик-инженер, работаю прогером. Слышал, что много биоинформатиков пришло из математиков и физиков.

Родился на улице Герцена, в гастрономе № 22. Известный экономист, по призванию своему — библиотекарь. В народе — колхозник. В магазине — продавец. В экономике, так сказать, необходим.

http://video.yandex.ru/users/lesko2007/view/116/

Ахахаха, сорри, но не смог удержаться. :)

не извиняйся, всё в точности про меня :)

Общался как-то с биоинформатиком, основное, что вынес из беседы — что нужно посчитать им говорят биологи, они сами решают замудренные диффуры, и кодят на R.

То есть они типа как простые прогеры, которые знают нужные инструменты, специальные алгоритмы и т.п., а в предметной области за них секут сторонние спецы?

https://www.coursera.org/course/bioinformatics

Как-то так, да. Очевидно, что по мере работы они в предметной области начинают разбираться все лучше, но глубоких знаний особо не требуется, главное знать математику на серьезном уровне.

Сколько биологии нужно для биоинформатики?

Очень по разному, есть грубо говоря две «касты» - слегка программирующие биологи и слегка знающие биологию математики.

Что из биологии нужно знать, чтобы заниматься биоинформатикой?

Зависит от задач. Во многих случаях достаточно знать лишь что цепочки днк состоят из четырех оснований, кодируемых буквами ATGC, а дальше сплошные строковые алгоритмы.

Есть примерный минимум какой-то?

Вообще рекомендовал бы http://libgen.org/book/index.php?md5=b5b8da547305b15e216e55c2baaa358a&ope... но лучше в подлиннике - http://libgen.org/book/index.php?md5=003C592935A04A8659F1813C47E42601&open=0

Ну как бы никто не мешает изучать собственно биологию по ходу работы и это даже наоборот приветствуется. В академии вообще принято консультировать друг друга по любым вопросам. Ну еще крайне полезно представлять суть стохастических процессов (например измеряется уровень экспрессии гена не в конкретной клетке а в популяции из нескольких миллионов, которая может быть и будет неоднородна), но у физиков думаю с этим проблем быть не должно.

Почитай истории успеха на фрикопедии :)

-- Молекулярную биологию, биофизику, геномику, генетику, евгенику.

евгенику

:)

Это которая изучает Евгениев?

спасибо за советы)

с этой книжкой знаком, у меня подруга биофакер)

Биоинформатика - весьма специфичная хрень, которая вертится вокруг генов и протеинов. Биологии там знать нужно, насколько я вижу по знакомым биоинформатикам, не особо много. Но, конечно же, никогда не помешает и чем больше, тем лучше. Впрочем, это не единственная область в биологии, в которой может пригодиться человек, шарящий в физике и математике. Таких еще очень ценят вот тут: http://en.wikipedia.org/wiki/Computational_neuroscience

евгенику.

Чтобы биореакторы научиться рассчитывать? :)

чувак, есть работа в одной из самых крутых лабораторий в стране. Нужны твои контакты.

Я напишу тебе на мыло в твоём профиле.

Он будет должен связать тебя со мной.

Из биологии больше всего пригодится химия.

Точно сказал!
Сам я биолог, точнее, биохимик и химии весьма много. А по теме - общей биологии хватит на уровне школы выпусков 80-90х гг, а вот молекулярной биологии или попгенетики для биоинформатики нужно как можно больше...