Моя программа для обработки данных фрагментного анализа ДНК

Ну… наверное, не совсем «не тот». Родственник, если я правильно понимаю, что в этой новости было написано:

Для платформы Android существуют сторонние порты:
Порт Stellarium Mobile (форк с компактным интерфейсом)
Порт оригинального Stellarium (форк с десктопным интерфейсом)

1024x768

Это серьёзно? Ты правда так живёшь?

В основе Stellarium Mobile Plus лежит проект с открытым исходным кодом Stellarium Web Engine. Это приложение разработано двумя братьями: Фабьеном Шеро, первоначальным создателем Stellarium, и Гийомом Шеро, активным участником проекта Stellarium.

Их же нет на ЛОРе? :)

Бывает хуже. На ноуте вмэсё гораздо лучше и там я делаю большую часть работы. А тут я не прям долго работаю, так что похер.

LebedevRI

Ради поддержки отечественного производителя кошкодевочек запилил ебилд прямо в репу (+pybaselines). Оно запустилось и даже показало картинки из тестовых файлов, но на этом мои полномочия всё.

Эт, поделись ссылкой на ебилд, а?) А то Генту тоже иногда щупаю, чтоб не терять квалификации и свежесть мозга. И вообще - не стесняемся слать пулл-реквесты в том числе со всякими скриптами для опакечивания.)

Про полномочия: ничего страшного, не все молекулярные биологи.)

П.С.: а я ещё гадал, что за ваххабит у меня репу форкнул.)

В биоинформатике не разбираюсь, но судя по исходникам на полноценную софтину как то не тянет.

P.S. Сгенерированные формы нужно хранить в отдельном файле и подключать к основной реализации через наследование.

Так я ж говорю - пулреквест в твой гитхаб послал с ебилдом. Ебилд конечно наколеночный, но работает вроде. Если нет - спрашивай в любое время.

ПС не один, а целых 8 - байт жи есть !

Ну, по возможностям до GeneMapper ясен красен, пока не дотягивает, а вот как альтернатива Peak Scanner ( https://www.thermofisher.com/md/en/home/life-science/sequencing/fragment-analysis/fragment-analysis-fundamentals/fragment-analysis-software-data-analysis.html ), только не зависящая от оборудования - вполне тянет.

А почему формы надо хранить отдельно и как это делать? Мне не очевидно, возможно потому что я таки исходно не 100% ИТ-шник.

П.С.: ну и я в принципе говорил, что в математике и многих других вещах всё ещё с разной степенью объективности считаю себя зоговым сквигом.

О, всё, увидел! Спасибо! Но есть несколько вопросов. Можно с тобой в ЛС списаться? В принципе, я есть в Телеграмме ( t.me/nurgle ) и ВК ( vk.com/dorif11 ). Напиши, а?

почему формы надо хранить отдельно и как это делать?

Примерно так:

$ pyside6-uic form.ui > form.py # создаём отдельный файл с формой

from PySide6 import QtWidgets
from form import Ui_Form

class MainWindow(QtWidgets.QMainWindow, Ui_Form):
    def __init__(self):
        QtWidgets.QMainWindow.__init__(self)
        self.setupUi(self)
        # дальше реализация логики формы

Кстати, обрати внимание на патч и pyproject.toml в contrib/gentoo/sci-biology/fragalyserqt/files, и на содержимое src_prepare(). Всё это вместе подгоняет код под стандарт новых питонячьих пакетов (PEP517 - тех, что pip install blabla). Я бы посоветовал втащить эти изменения прямо в твой код - и ебилд сократится, и прогу можно будет опакетить и положить в PyPI. Тогда любой питоновод (питоновед ?) в любой оси сможет сказать pip install fragalyseqt несмотря на отсутствие или наличие в родном репозитории.

Местным питоноэкспертам (Rodegast ?)- прокомментируйте содержимое плз, я этот pyproject.toml сегодня первый раз увидел.

Попробую.

За pyproject.toml отдельное спасибо - от головняка избавили. Но желание поговорить в ЛС таки же только возросло.

А, действительно, почему не UGENE?

Моя программа для обработки данных фрагментного анализа ДНК (комментарий)

Молодца. Больше всего меня радует что та хрень за 16 килобаксов в результате помрёт

Врядли помрёт, ибо сертифицирована по самые помидоры и выпускается производителем оборудования для, собственно, капиллярного фореза. Ну и, соответственно, имеет свою нишу.

Но что-то поменяться может. В случае мудрых менеджеров (а сейчас мне кажется, так и есть, судя по взаимодействию с ними) - они станут более открытыми, в случае дурных - попробуют огородиться по самое небалуйся, чтоб никто не подлез. Ну и GeneMapper ID-X 1.7 уже юзает PostgreSQL вместо Oracle, став при этом гораздо быстрее запускаться.

Да, собственно, вымирание того софта и не является моей целью. Я хочу просто иметь возможность обработать полученные данные где угодно и как мне угодно, не привязываясь к софту, прибору, панели… Ну и того же самого хочется и для других. Плюс это даёт открытость и проверяемость алгоритмов обработки данных и лучшую их воспроизводимость.