Хорошей IDS не бывает много.
AFIK (http://afick.sourceforge.net/) добавляет еще один уровень защиты к portsentry и chkrootkit, отслеживая целостность файлов и предупреждая о незапланированных изменениях. В статье описан принцип работу и процедура установки на примере FC1.