Проблема следующего характера: программа принимает аргумент длинной более 5000 символов из командной строки, однако при чтении обрезается до 4095 символов.
Пример:

QTextStream qcin(stdin);
QByteArray str;
qcin >> str;

str.clear();
str.append(qcin.readLine(10000));