Сборка которую я использую неудачная попалась. После стандартной установки(да и при любой тоже) не принимает пароль gksu.
Причем sudo работает нормально, вот что говорит gksu:

broderix@debian:~$ gksu gdmsetup
Извините.

broderix@debian:~$ gksu -d gdmsetup
xauth: -6f166fcd40f22153b7d3075d076fe703
-
display: -:0.0-
final xauth: -6f166fcd40f22153b7d3075d076fe703
-
final display: -:0.0-
STARTUP_ID: gksu/gdmsetup/4928-0-debian_TIME3079418928
gksu_context_run: buf: -Password: -
password: (null)
password: ***********
DEBUG (run:after-pass) buf: -Password: -
DEBUG (run:post-after-pass) buf: -
ssword: -
DEBUG (run:post-after-pass) buf: -su: Authentication failure
Извините.
-
DEBUG (auth_failed) buf: -su: Authentication failure
Извините.
-
xauth: -6f166fcd40f22153b7d3075d076fe703
-
display: -:0.0-
final xauth: -6f166fcd40f22153b7d3075d076fe703
-
final display: -:0.0-
gksu_context_run: buf: -Password: -
password: (null)
password: (null)
gksu_su_full: problem getting password - getting out
error: Password prompt canceled.

root@debian:/# tail /var/log/auth.log
May 10 14:47:57 localhost su[4920]: pam_authenticate: Authentication failure
May 10 14:47:57 localhost su[4920]: FAILED su for root by broderix
May 10 14:47:57 localhost su[4920]: - pts/7 broderix:root
May 10 14:48:47 localhost su[4933]: (pam_unix) authentication failure; logname= uid=1000 euid=0 tty=pts/7 ruser=broderix rhost=  user=root
May 10 14:48:48 localhost su[4933]: pam_authenticate: Authentication failure
May 10 14:48:48 localhost su[4933]: FAILED su for root by broderix
May 10 14:48:48 localhost su[4933]: - pts/7 broderix:root

и теперь самое интересное:
broderix@debian:~$ gksu -d -S gdmsetup
No ask_pass set, using default!
xauth: /tmp/libgksu-YZ0XpE/.Xauthority
STARTUP_ID: gksu/gdmsetup/4992-0-debian_TIME3080164400
cmd[0]: /usr/bin/sudo
cmd[1]: -H
cmd[2]: -S
cmd[3]: -p
cmd[4]: GNOME_SUDO_PASS
cmd[5]: -u
cmd[6]: root
cmd[7]: --
cmd[8]: gdmsetup
buffer: -GNOME_SUDO_PASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSSSS-
brute force GNOME_SUDO_PASS ended...
Yeah, we're in...
xauth: /tmp/libgksu-YZ0XpE/.Xauthority
xauth_env: /home/broderix/.Xauthority
dir: /tmp/libgksu-YZ0XpE

Вуаля, все сработало.
Качать стабильный релиз и ставить заново не хочу. 
Не помогло и это:
root@debian:/# apt-get update
root@debian:/# apt-get install gksu
root@debian:/# dpkg-reconfigure gksu

Что делать?