В том смысле, что вот есть ворох файлов с дистрибутивом ПО - куча обычных, куча поддиректорий, и у всего этого нет директории верхнего уровня. Т.е. если распаковать такой архив в директории, где уже есть файлы, получится мешанина из собственных файлов и файлов из архива.

В комментах можно указать, используются ли (или были использованы) коммиты/баг-репорты/проч. для выполнения наемной работы.