LINUX.ORG.RU

Вычислительный нод не регистрируется в системе slurm

 , ,


0

1

Добрый день!

На управляющем узле стоит Debian 8 и можно установить slurm только версии 14.03.9. На вычислительных нодах захотел обновить систему до Debian 9. И там поставился slurmd 16.05.9. В результате, с управляющего узла нод пингуется. И на управляющем узле сервис slurmctld и на ноде slurmd работают. Однако нод в sinfo всё равно имеет статус down.

scontrol show slurmd

на ноде выдаёт

Active Steps             = NONE
Actual CPUs              = 32
Actual Boards            = 1
Actual sockets           = 4
Actual cores             = 8
Actual threads per core  = 1
Actual real memory       = 257950 MB
Actual temp disk space   = 1024 MB
Boot time                = 2019-10-22T20:23:44
Hostname                 = cn5
Last slurmctld msg time  = NONE
Slurmd PID               = 967
Slurmd Debug             = 3
Slurmd Logfile           = /var/log/slurm-llnl/slurmd.log
Version                  = 16.05.9

Т.е. он не разу не зарегистрировался.

Лог по адресу /var/log/slurm-llnl/slurmd.log выдаёт

[2019-10-23T06:25:06.031] Considering each NUMA node as a socket
[2019-10-23T06:25:06.032] Node configuration differs from hardware: CPUs=32:32(hw) Boards=1:1(hw) SocketsPerBoard=2:4(hw) CoresPerSocket=16:8(hw) ThreadsPerCore=1:1(hw)
[2019-10-23T06:25:06.032] Message aggregation disabled
[2019-10-23T06:25:06.034] Resource spec: Reserved system memory limit not configured for this node
[2019-10-23T06:25:06.056] error: slurm_receive_msg: Zero Bytes were transmitted or received
[2019-10-23T06:25:06.066] error: Unable to register: Zero Bytes were transmitted or received
[2019-10-23T06:25:07.077] error: slurm_receive_msg: Zero Bytes were transmitted or received
[2019-10-23T06:25:07.087] error: Unable to register: Zero Bytes were transmitted or received
[2019-10-23T06:25:08.099] error: slurm_receive_msg: Zero Bytes were transmitted or received
[2019-10-23T06:25:08.109] error: Unable to register: Zero Bytes were transmitted or received

На всякий случай ещё прикреплю конфиг файл slurm

# slurm.conf file generated by configurator.html.
# Put this file on all nodes of your cluster.
# See the slurm.conf man page for more information.
#
ControlMachine=master
ControlAddr=192.168.8.8
#BackupController=
#BackupAddr=
# 
AuthType=auth/none
CacheGroups=0
#CheckpointType=checkpoint/none 
CryptoType=crypto/openssl
#DisableRootJobs=NO 
#EnforcePartLimits=NO 
#Epilog=
#EpilogSlurmctld= 
#FirstJobId=1 
#MaxJobId=999999 
#GresTypes= 
#GroupUpdateForce=0 
#GroupUpdateTime=600 
#JobCheckpointDir=/var/lib/slurm/checkpoint 
JobCredentialPrivateKey=/NAS_config/slurm/keys/key
JobCredentialPublicCertificate=/NAS_config/slurm/keys/certificate
#JobFileAppend=0 
#JobRequeue=1 
#JobSubmitPlugins=1 
#KillOnBadExit=0 
#LaunchType=launch/slurm 
#Licenses=foo*4,bar 
#MailProg=/usr/bin/mail 
#MaxJobCount=5000 
#MaxStepCount=40000 
#MaxTasksPerNode=128 
MpiDefault=none
#MpiParams=ports=#-# 
#PluginDir= 
#PlugStackConfig= 
#PrivateData=jobs 
ProctrackType=proctrack/pgid
#Prolog=
#PrologFlags= 
#PrologSlurmctld= 
#PropagatePrioProcess=0 
#PropagateResourceLimits= 
#PropagateResourceLimitsExcept= 
#RebootProgram= 
ReturnToService=2
#SallocDefaultCommand= 
SlurmctldPidFile=/var/run/slurm-llnl/slurmctld.pid
SlurmctldPort=6817
SlurmdPidFile=/var/run/slurm-llnl/slurmd.pid
SlurmdPort=6818
SlurmdSpoolDir=/var/lib/slurm-llnl/slurmd
SlurmUser=slurm
#SlurmdUser=root 
#SrunEpilog=
#SrunProlog=
StateSaveLocation=/var/lib/slurm-llnl/slurmctld
SwitchType=switch/none
#TaskEpilog=
TaskPlugin=task/none
#TaskPluginParam=
#TaskProlog=
#TopologyPlugin=topology/tree 
#TmpFS=/tmp 
#TrackWCKey=no 
#TreeWidth= 
#UnkillableStepProgram= 
#UsePAM=0 
# 
# 
# TIMERS 
#BatchStartTimeout=10 
#CompleteWait=0 
#EpilogMsgTime=2000 
#GetEnvTimeout=2 
#HealthCheckInterval=0 
#HealthCheckProgram= 
InactiveLimit=0
KillWait=30
#MessageTimeout=10 
#ResvOverRun=0 
MinJobAge=300
#OverTimeLimit=0 
SlurmctldTimeout=120
SlurmdTimeout=300
#UnkillableStepTimeout=60 
#VSizeFactor=0 
Waittime=0
# 
# 
# SCHEDULING 
#DefMemPerCPU=0 
FastSchedule=1
#MaxMemPerCPU=0 
#SchedulerRootFilter=1 
#SchedulerTimeSlice=30 
SchedulerType=sched/backfill
SchedulerPort=7321
SelectType=select/linear
#SelectTypeParameters=
# 
# 
# JOB PRIORITY 
#PriorityFlags= 
#PriorityType=priority/basic 
#PriorityDecayHalfLife= 
#PriorityCalcPeriod= 
#PriorityFavorSmall= 
#PriorityMaxAge= 
#PriorityUsageResetPeriod= 
#PriorityWeightAge= 
#PriorityWeightFairshare= 
#PriorityWeightJobSize= 
#PriorityWeightPartition= 
#PriorityWeightQOS= 
# 
# 
# LOGGING AND ACCOUNTING 
#AccountingStorageEnforce=0 
#AccountingStorageHost=
#AccountingStorageLoc=
#AccountingStoragePass=
#AccountingStoragePort=
AccountingStorageType=accounting_storage/none
#AccountingStorageUser=
AccountingStoreJobComment=YES
ClusterName=cluster
#DebugFlags= 
#JobCompHost=
#JobCompLoc=
#JobCompPass=
#JobCompPort=
JobCompType=jobcomp/none
#JobCompUser=
#JobContainerPlugin=job_container/none 
JobAcctGatherFrequency=30
JobAcctGatherType=jobacct_gather/none
SlurmctldDebug=3
SlurmctldLogFile=/var/log/slurm-llnl/slurmctld.log
SlurmdDebug=3
SlurmdLogFile=/var/log/slurm-llnl/slurmd.log
#SlurmSchedLogFile= 
#SlurmSchedLogLevel= 
# 
# 
# POWER SAVE SUPPORT FOR IDLE NODES (optional) 
#SuspendProgram= 
#ResumeProgram= 
#SuspendTimeout= 
#ResumeTimeout= 
#ResumeRate= 
#SuspendExcNodes= 
#SuspendExcParts= 
#SuspendRate= 
#SuspendTime= 
# 
# 
# COMPUTE NODES 

NodeName=cn[1-13] NodeAddr=192.168.3.[1-13] CPUs=32 Sockets=2 CoresPerSocket=16 State=UNKNOWN
PartitionName=main Nodes=cn[1-13] Default=NO MaxTime=INFINITE State=UP

Вопрос, ошибка связана с разной версией slurm на управляющем узле и нодах и придётся обновлять систему и на управляющем узле, что бы была возможность обновить slurm или всё таки ошибка с какими то настройками и есть возможность запускать slurm на разный версиях ОС.

Хороший вопрос, сильный ...

наверно МГУ-шный форум будет более подходящим (и у них там на Ломоносове кажись таки slurm).

Я вот только такие ресурсы нашел один или два ... у них там версии 17, 18, 19 Ж-)

sshestov ★★
()
Ответ на: Хороший вопрос, сильный ... от sshestov

наверно МГУ-шный форум будет более подходящим

Для кого, документацию пишут, не понятно.

Slurm daemons will support RPCs and state files from the two
previous major releases (e.g. a version 17.11.x SlurmDBD
will support slurmctld daemons and commands with a version
of 17.11.x, 17.02.x or 16.05.x).

Т.е. 16.05 должен работать с 15.08 и 14.11, но не с 14.03.

xaizek ★★★★★
()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.