Вот тут http://help.ubuntu.ru/wiki/backup говорится следующее:
Сразу стоит отметить, что все операции стоит производить не «по-живому», т.е. не на работающей системе, а с liveCD или установленной на соседнем разделе/флэшке/usb-hdd системы. В случаях, когда простой в несколько минут критичен для системы, возможно копирование системы из-под самой себя, но при этом нужно учитывать некоторые дополнительные условия, которые в данной статье пока что не рассматриваются
В каких случаях и почему не стоит делать бекап или восстанавливаться «по-живому»? Какие могут быть проблемы?