Чтобы Скрипт стартовал при загрузке системы

Я так понимаю, что ты его пихал в /etc/rc.d/init.d. Но кроме этого надо на него ещё сделать линк для старта и окончания уровня выполнения. То есть, что бы ты мог его запускать, скажем на 5 уровне (дефолтный в Красношапке) надо его залинковать, как S-скрипт:
ln -s /etc/rc.d/init.d/your_script /etc/rc.d/rc5.d/SXXyour_script
И для выгрузки шрифта в 5 уровне:
ln -s /etc/rc.d/init.d/your_script /etc/rc.d/rc5.d/KXXyour_script
Где XX-порядковый номер для стартующего(заканчивающегося) скрипта. Рекомендую его сделать побольше.
Второй вариант прописать сам скрипт в rc.local.

в директории /etc/rc.d/ есть файл rc.local он гарантированно запускаются сразу же после загрузки системы
можешь написать и свой скрипт... включить его запуск в файл rc.local и радоваться жизни...

есть более красивые методы конечно...

например в /etc/sysconfig есть куча скриптов и настроечных файлов.
там ты сможешь написать например скрипт который будет запускаться при инициализации eth0 и т.д.

у человека сервер насколько я понял, так что дефолтовый уровень никак не 5-й, а 3-й :) А насчет пятого: ты чего иксы стартуешь сразу чели или как ? :)