Кто нибудь встречал файловую систему с квотами на директорию (с поддиректориями)? Квоты не на пользователя/группу, а именно на общий размер директории.
Сейчас задача решается нарезанием и монтированием томов lvm/thinlvm соответствующих размеров в нужные поддиректории, что довольно трудозатратно и негибко.