Как редактировать конфиг nextcloud, если он установлен через snap

Не мучаться и поставить через докер.

Докер не нужен так же как и все остальное снапофлатпаки.

https://github.com/nextcloud-snap/nextcloud-snap/wiki/Included-CLI-utilities

Используй nextcloud.occ, или редактируй файл в /var.

я тоже так утверждал пока не понял, что всякие флатпаки не нужно настраивать и частичные обновления экономят гигабайты ресурса SSD ежедневно

Настраивать нужно то, что ты хочешь настроить, флатпаки тут ни при чём. Дефолтные конфиги и без них существуют. А что там за ежедневная экономия совсем непонятно, обновлять одну и ту же библиотеку 10 раз вместо одного?

достаточно сравнить как шрифты в твоем браузере выглядят с эталонным у разраба и тп наука и небольшая, но со временем надоедает доставлять шрифты, кодеки, вспомогательные либы, ковырять настройки…

Я не настраивал у себя в браузере никакие ни шрифты ни кодеки, ни тем более вспомогательные либы (этим apt занимается). А если захочу настроить - то уж точно не методом копипаста вкусовщины от флатпак-сборщика.

экономят гигабайты ресурса SSD ежедневно

лол. что за экономия на спичках

Дарю идею. Перенесите на старенькие ide/scsi харды, они кондовые были... не в пример новомодных sata. У них реально под крышкой воздуха мало-мало было, не одну отвертку погнули ради добычи полезных и просто приятных глазу внутренностей.

экономят гигабайты ресурса SSD ежедневно

лол. что за экономия на спичках

Ничего вы не понимаете. Не первый раз слышу о таком, что его(SSD) не использовать, а «показывать надо» (с)
Кажется я уже говорил о своих предположениях, что последователи культа, после покупки M.2 сразу ламинируют и на стену вешают в титановую рамочку с небьющимся стеклом.