система документирования .

слишком расплывчато - что именно надо-то ? что есть "документировать" в вашем понятии ? имхо, готовых универсальных решений нет. любая субд + qt/gtk и самому ваять что хошь.

а не сушествует ли каких нибудь стандартов на эту тему ?

что надо от системы , ну например возможность легко изменять разные параметры . 

понятно что можно написать самомоу , но если я потом уволюсь  , кто будет это разгребать ...

типа подошло бы что-то типа wikipedia , но наверное есть похожие проекты , надо бы сначала ознокомится с ними .

Да, действительно, можно взять любую из вик-систем. Это если нужно что-то простое, для описания настроек сервера и сети.

Если работа касается девелопинга в той или иной области и то можно попробовать trac.

plone много чего умеет.

Есть разнообразные модули - inventory management, project tracking

tnx посмотрю .