У меня вопрос: ты сколько не обновлялся? Ничего из перечисленного тобой не заметил. Автомонтированием флешек не пользуюсь, никаких предупреждений от consolekit не заметил, ждущий режим проверил - работает.
Раз уж тут скатывается в systemd-срач, внесу свои 5 копеек.
Дожили, блджад, до времён, когда приходится смотреть в список обновляемых пакетов и при наличии там строчки systemd, перезагружать машину. Винда виндой.
# emerge consolekit
...
* Messages for package sys-auth/consolekit-0.4.6:
* CONFIG_AUDITSYSCALL: is not set when it should be.
* Please check to make sure these options are set correctly.
* Failure to do so may cause unexpected problems.