Открывается две копии Kate в KDE

Двойной щелчок мыши в dolphin? Если да, то это нормально, по умолчанию dolphin открывает файлы по одному клику.

Если бы всё так просто было... :))

Нет, такое происходит абсолютно всегда, даже если через консоль открывать.

Прямой запуск бинарника что даёт?

мб в /usr/bin скрипт запуска, а не бинарник который запускает редактор 2 раза?

выхлоп file $(which kate) в студию

Разобрался.

Если открыть новое окно через панель инструментов (View -> New window), открывается копия редактора. Можно наплодить таких окон сколько угодно много. Окно можно закрыть просто крестиком в тайтл-баре или Alt+F4. В данном случае закроется только текущее окно. А я всегда закрывал редактор, нажимая Ctrl+Q. При таком выходе, открывая новую сессию Kate, открывается тоже количество окон, что и было ранее.