А вот тут я не знаю. Я это представляю так, будто гостевая ОС работает с абстракцией диска и подвоха на ждет, а тут внезапно на каждую запись идет фрагментация того, что система считала простым как три копейки носителем и все ее предположения (например про блоки) и оптимизации (например readahead) начинают служить больше злу, чем добру. Но как видишь, я далеко не эксперт. Просто напоролся на это как перелез везде на btrfs, нагуглил, что я 'got bitten by a CoW' и запомнил, что прозрачный CoW нужен не везде.