В таком случае, может, у тебя проблема с файловым менеджером? qBittorrent-то не сам директорию открывает, он запускает ФМ и ему указывает путь, который открыть надо.
Вот, а весь цимес в том, что в URL, вообще-то, не должно быть пробелов, и вариант с %20 является правильным. Собственно, твой qbittorrent запускает xdg-open с правильным вариантом URL, а дальше, судя по всему, твой xdg-open не выполняет всё, что он должен сделать.
Когда ты делаешь
xdg-open file:///media/1000gb/Видео%20и%20музыка
что оно в консольке пишет? У меня вот так это выглядит:
Ничего. Просто переносит строку для ввода следующей команды, а вместе с этим появляется окно с текстом «/media/1000gb/Видео%20и%20музыка: Нет такого файла или каталога»