А как в наутилусе выделять файлы мышкой?

Ctrl западло?

Отвык от этой пакости и больше нет в ней необходимсти, чего и Вам желаю)

Религия мышкорианства запрещает пользоваться клавиатурой, а так же ставить монитор на против солнца. Великий бог Гуй может не одобрить и покарать неверных осмелевшихся воспользоваться этим еретичнвм изделием Люцифера — клавиатурой.

по привычке начинаю выделять и в результате файлы и каталоги перетаскиваются. или может drag&drop можно выключить?

Да поставь тунар или псманфм и не мучайся! Насколько я знаю, драг-н-дроп неотключаемый.