Запуск программ wine под виндовым администратором

Чего ты пытаешься этим добиться? Вайн это только тонкая ограниченая обёртка для запуска экзешников как нативных бинарей.

По умолчанию же.

Так запускай от рута. Ну там su - или sudo -i и так далее прочие gksu/kdesu.

Кто нибудь знает как в wine запускать программы под виндовым админом?

Это ненужно под вайном.

Если программа требует UAC, то включи в настройках эмуляцию Windows XP.