При открытии терминал не открывается на всю область, а рисует правильный размер, что оставляет полосу внизу.
В DWM решалось опцией resizehints = 0. В xmonad забыл.
P.S. Почему xmonad? Его лень «внезапно» помогает меньше греть ноут, когда много всяких окон открыто (intel).