Как бэкапил? Как пробовал?

Это не важно. Я просто хотел указать, что на старом (том же по версии) линуксе все работало. Бэкапил по-своему. Скажу, что в конце заново установил через ISO-образ.

Пробовал

Переустанавливал в софт-центре, скачивал архив с сайта, скачивал через терминал gnuplot-x11

Это не важно.
Бэкапил по-своему.

Ясно. Проходите дальше.

Я вам написал, что в конце на холостой компьютер загружал с флешки образ. Не думаю, что проблема может возникнуть в простой установке.

Ты от нас чего конкретно хочешь? Свечку тебе подержать, пока ты горюешь, что ничего не работает после твоих «по-своему» телодвижений? Так извини, свечки закончились. Да и телепаты в отпуске до сих пор. Если помощи в решении проблемы хочешь - выкладывай явки, пароли, версии, все описывай вместе с логами, че делал и как. В противном случае получить ты можешь только «Ну поломалось че-то» в качестве ответа, ибо какой вопрос, такой и ответ.

Gnuplot не было ещё до сегодняшней проблемы. В прошлом линуксе я не смотрел на его существование. Думаю, у вас такие же условия. Поэтому также вероятно, что я туплю. Вопрос в том, чтобы спросить у профессионала, как «активировать» функционал? Иначе, как вы установили gnuplot? Единственное, что есть: Бэкапил командой rm ~/ , а потом заново устанавливал с флешки. После ввода gnuplot --persist file.gnu ничего не происходит.

Ты патчил, а не бэкапил.

Вы правы. Может ли в этом «безобидном» патче сломаться gnuplot в новой ОС? Тогда логично, что для установки Linux совместно с другой ОС данные gnuplot остаются только в Linux. То есть всё должно было работать независимо от хронологии установки на холостой компьютер.