Если атом сохраняет настройки в хомяке и вообще у него есть совместимость между версиями по настройкам и плагинам то просто опять качай deb и устанавливай его, он заменит старую версию. Удалять старую версию не надо, просто новый пакет с атомом обновит текущий твой атом.
каждый раз думаю как иронично было назвать атомом жирнющий как слон софт
Вот хорошее руководство по созданию локального репозитория пакетов, в вашем случае, просто скачать новый deb пакет в локальный реп и менеджер пакетов предложит обновить пакет
Тема глубокая много подводных камней. Если тебя редактор устраивает всем, тебе удобно и всё такое. Просто пользуйся и никого не слушай. Каждый своё болото хвалит.
Не знаю. Напиши статью/заметку/иное по своей деятельности интересную. Удиви всех нестандартным подходом. Тему создал, а она не с вопросом, фиу ха! Шок контент для ЛОРа будет.