Хороший звуковой генератор

Всё можно сделать с помощью cSounds

Программные синтезаторы: amSynth, Piz Mr.Alias.

синус, теугольник, прямоугольник, пилу

gstreamer умеет как раз это, и еще шумы - http://www.gstreamer.net/data/doc/gstreamer/head/gst-plugins-base-plugins/html/gst-plugins-base-plugins-audiotestsrc.html. Я его как раз и использовал для этого (хотя мне в основном шумы надо было), через gst-launch.

И чтоб, главное, умел делать пачки импульсовм разной длительности.

А вот такого не делал, не знаю. Но у гстримера довольно навороченная функциональность, так что может и возможно такое сделать.