запуск программ под рутом

а запускаете как? надеюсь, через sudo?

ssh -XY -l root localhost


gksu

kdesu

http://tinyurl.com/35cynyd

Тысячу раз разжёвано, в том числе и на этом форуме.

нет. сначала su <passwd>. Потом имя программы

xhost +
su -c gedit

100500 раз было, man поиск.

Перед su введите xhost + или воспользуйтесь программой sux (aptitude install sux). Или вообще настройте sudo.

после xhost + выдает:
аccess control disabled, clients can connect from any host

после su -c dolphin:
<unknown program name>(28585)/: KUniqueApplication: Cannot find the D-Bus session server: «Did not receive a reply. Possible causes include: the remote application did not send a reply, the message bus security policy blocked the reply, the reply timeout expired, or the network connection was broken.»

<unknown program name>(28581)/: KUniqueApplication: Pipe closed unexpectedly.

Тогда http://www.linux.org.ru/jump-message.jsp?msgid=5223317&cid=5223373
не dolphin - у меня работает.

Нет, вру, и dolphin работает тоже.

у вас кеды целиком стоят или только один дельфин?

возможно тут дело в другом. при ззапуске glxgears от обычного пользователя вот что выдает:

sacred@debian:~$ glxgears
Running synchronized to the vertical refresh. The framerate should be
approximately the same as the monitor refresh rate.
9307 frames in 5.0 seconds = 1861.320 FPS
XIO: fatal IO error 22 (Invalid argument) on X server ":0.0"
after 39 requests (39 known processed) with 0 events remaining.

те опять что-то не так с Х сервером

У меня вообще голый openbox ) Даже hal и dbus не запущены.

у меня тоже опен бокс

Хотя установлены целиком, да.

Обычно самый первый X-server имеет :0.0 номер.
Возможно дело в том, что он не такой?