LINUX.ORG.RU
решено Форум — Desktop  

Чем нарисовать кристаллическую решетку.


0

1

Есть файл xyz с декартовыми координатами атомов в элементарной ячейки, хотелось бы нарисовать весь кристалл. В принципе avogadro справляется с такой задачкой, но не соединяет соседние атомы палочками, а хотелось бы. Чем еще можно воспользоваться?

Хотелось бы получить картинку на подобии этой

http://radikal.ru/F/i034.radikal.ru/1103/0f/17aa821c7121.png.html

★★★★
← clutterflow в ubuntu lucid
Синхронизация каталогов →

Если тебе нужен визуализатор, то можешь посмотреть pymol. Он, конечно, больше по биологическим молекулам. Но адаптировать не сложно.

silw ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от silw

pymol для периодических систем приспособлен мало.

А тут тебе и ячейки Вигнера-Зейтца, и переключение между примитивной и обычной ячейкой. С федоровскими группами правда не все работают.

mclaudt ☆
()
Ответ на: комментарий от mclaudt

>XCrysden

Это интересно, спасибо.Ну а пока обошелся скриптиком для вычисления нужных координат атомов и их обрисовки на убогом недоязычке.

RCV ★★★★
() автор топика
Ответ на: комментарий от greenzu

>>Вообще куча их. Например: DRAWxtl, VESTA, V_Sim, VISIT.

В каких хотябы частично сделана поддержка групп симметрии? Т.е. чтобы программа сама генерировала связанные операциями симметрии атомы.

mclaudt ☆
()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.
← clutterflow в ubuntu lucid
Desktop
Синхронизация каталогов →