перезапуск iptables и ip6tables в ubuntu 10.10

но мне показалось странным что такая очевидная возможность не предусмотрена изначально.

man iptables

-F, --flush [chain]
Flush the selected chain (all the chains in the table if none is given). This is equivalent to deleting all the rules one by one.

Мне кажется странным постить что-то на ЛОРе в техразделах, не исследовав ситуацию хоть сколько-то.
iptables-save, iptables -F, iptables-restore.

В /etc/init.d/ скрипта в убунте нет, что ли?

Да, согласен, благодарю за информацию.

В /etc/init.d/ скрипта в убунте нет, что ли?

В том-то и проблема, что нет.

Ну так добавь

cat << EOF >> /etc/init.d/iptables
### BEGIN INIT INFO
# Provides:          fw
# Required-Start:    $network $syslog
# Required-Stop:     $network $syslog
# Default-Start:     2 3 4 5
# Default-Stop:      0 1 6
# Short-Description: Start fw at boot time
# Description:       Enable Firewall and policy routing.
### END INIT INFO

Здесь свои правила
EOF

insserv /etc/init.d/iptables

неплохо было бы вспомнить, что в убунте апстарт, перед такими советами.