Прибивать их при помощи wmctrl?

А killall не умеет правильно выключить приложение?

sudo killall Xorg

gdm тут не поможет, тут скорее gnome-session запускать, и выходить через gnome-session --logout-dialog | --shutdown-dialog. Да если подумать, так ли уж это чревато, убивать их без спроса? Лиса предложит восстановлеие сессии, а vim… пусть автосохраняет.
Если уж оче надо помягче, то для выхода можно пинать что-то вроде
[code]
killall -u myusername
[/code]

killall убивает, а не закрывает.

killall убивает, а не закрывает.

Чушь kill посылает приложению сигнал. Приложение может его отработать и закрыться. Убивает kill -9

Да что ты говоришь? «Закрыть» приложение - это ли не вызов SIGTERM?

Вроде бы то, что нужно. Спасибо.

С этим хуком http://xmonad.org/xmonad-docs/xmonad-contrib/XMonad-Hooks-EwmhDesktops.html работает.

Теперь дело за малым, найти/написать скрипт, который получает список окон окон и все их закрывает.

#!/bin/bash

for i in $(wmctrl -l | awk '{print $4}')
do
wmctrl -c $i
done


Как-то так, по мотивам http://crunchbanglinux.org/forums/topic/10199/closeallwindows/

А ещё лучше так:

#!/bin/bash

for i in $(wmctrl -l | awk '{print $1}')
do
wmctrl -ic $i
done

Systemd умеет завершать все процессы, открытые в сессии, при закрытии сессии, если использовать pam_systemd.so и systemd-logind. И не нужны никакие скрипты-костыли, которые закрывают только окна.

Вот только всякое УГ, вроде опенофисов и огнелисов, kill -15 не обрабатывает нифига, а просто дохнет.

Ну так это проблемы конкретных программ. Стоит написать разработчикам об этом, а не городить костылей.

4.2

:)

<зануда>
for i in $( wmctrl -l | cut -d' ' -f1 )
</зануда>

Это опенсорс: https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=336193
Без костылей никак.