Смотрю примеры, пока ничего не понимаю.
if USING_EMSCRIPTEN
%.html: %.o $(top_builddir)/cogl/.libs/libcogl2.so $(top_builddir)/deps/glib/.libs/libglib.a
$(CC) $(AM_CFLAGS) $(CFLAGS) --js-library $(top_srcdir)/examples/emscripten-example-js-library.js -o $@ $^
all-local: $(addsuffix .html, $(programs))
endif