Что еще за интервал тишины...?

штиль

Ну записал в порт, сделал flush (ну или как там принудительно отправку сделать), сделал sleep.

Так всегда делается, других вариантов нет?

Ты читаешь описание физического уровня. Если ты используншь готовую железку, в ней скорее всего есть драйвер который все это за тебя сделает, а ты просто байтики гонять должен.

В армии я был радиотелеграфистом. И там понял страшную штуку — морзянка имеет 4 символа в алфавите. Ну 3 в крайнем случае. Иначе она не может быть распаршена. Короткий, длинный сигнал и пауза. Без паузы между литерами анализ данных невозможен.
Тут, видимо, такая же хрень.

У кадра Modbus RTU нет синхронизирующей последовательности, поэтому начало и конец кадра определяется по паузе.

Скорее всего длительность этой паузы используется физическим уровнем вашего устройства для переключения из режима передачи в режим приема.

Что делать? Не отправлять кадр фрагментированно или побайтно с паузами большими, чем требуется.

Тихий час.

Всё просто передача 1го символа занимает N мс. Перед и после окончания мы должны делать паузы длительностью N * 3.5, получив это время мы его и учитываем и учитываем что уже передавая само сообщение мы не должны делать пауз более чем N*1.5 вот и всё тоесть

пауза тело сообщения пауза тело сообщения пауза 

если ты сам не разрабатываешь этот протокол то ничего, тупо взять libmodbus и им пользоваться, он там все эти тайминги сам разрулит.