хочу распараллелить последовательную подпрограмму с помощью openmp. подпрограмма представляет собой обход дефрагментированого разреженного массива F(N1,N2), где N1~500, N2~100000. в служебном массиве V(N1)<N2 хранится значение последнего значимого элемента подмассива F(i,:).
значимые элементы содержат в себе фазовые вектора частиц p=(x,v,i) где x — координата, v — скорость, i — номер узла, причём в F(i,:) хранятся лишь те вектора, чей (x) лежит в заданном интервале (т.е. все вектора локализованы)
в процессе счёта значения x меняются так, что частица может или перескочить в соседний узел или остаться в том же.
сейчас я просто обхожу последовательно все узлы i=0..N1, все вектора j=0..V(i), провожу вычисления, и в случае, если x не соотвествует узлу i, то переношу его значение в соседний узел i2, а на его место записываю нижнее значение из F(i,V(i)) (и делаю V(i)-1, V(i2)+1).
как организовать такой обход массива при параллельном расчёте? пока на ум приходит только завести массив такого же ранга F2, все сложные вычисления проводить параллельно в F, а затем обойти F последовательно, копируя значения в уже в нужные узлы F2, но это явно непотимально. какие есть ещё варианты? с учётом того, что порядок в котором вектора записаны внутри F(i,:) не имеет значения. ссылки на статьи приветствуются.