Как отключить курсор у окна?

Мыши что-ли? Ну можно же его менять, в разных тулкитах по-разному, так нужно наверное сменить на пустой.

http://www.motifdeveloper.com/tips/tip9.html

делаю XDefineCursor(..., None) никуда курсор не пропадает

Еще раз прочитай текст по ссылке. Курсор нужно делать из пустого pixmap'а, например.