Какие тулы, ЯП, ОС используют в yandex, google ?

http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Google_software

почему бы тебе у них не спросить? напиши официальное письмо.

Касательно Яндекса, вот это должно дать общие представления: http://company.yandex.ru/job/vacancies/

В основном упор на легковесные минималистичные технологии. Впроде spring, cherrypy, mysql и так далее. ОС Linux доминирующая. И много своих разработок. Вообще любая серьезная контора создает стек технологий под себя.

ОС используют в yandex, google ?

Ubuntu-based Linux.

Вот что знаю про Яндекс:

https://github.com/reverbrain/elliptics/ - Key/value хранилище, C++, используется в Яндекс.Музыка, Яндекс.Карты, Яндекс.Маркет.

https://github.com/berekuk/Ubic - Сервис менеджер, замена init scripts, upstart и.т.п., Perl

http://bem.info https://github.com/bem/project-stub - Ну про БЭМ и так все знают ;) JavaScript + node.js

Для кэша на некоторых сервисах используется lighttpd.

Как видно, стек технологий довольно разнообразный, что и не удивительно.

http://lanyrd.com/2012/fprog-10/sykyz/

в какой-то степени используют всё. В крупных корпорациях недобра обычно нет завязки на определённые технологии/инструменты сразу для всех проектов.