по поводу как просто добавить один проект к другому, без бинарной зависимости, см. info autoconf на предмет AC_CONFIG_SUBDIRS. Если оба проета под КДЕ, то скорее всего достаточно будет просто скоировать каталог с иходниками из первого во второй, и дописать SUBDIRS в Makefile.am, и поправить configure.ac.
Первый проект это просто бинарник второй проект это грубо говоря большая библиотека(там две цели 1-сама библиотека 2-доп приложение,использующее эту библиотеку) мне ессно 2 цель не нужна нужна тока 1-ая. Если руками то Makefile'ы я скрещу, а вот с конфигурами и прочими скриптами я не знаю как быть :(. Вот и думал что KDevelop может иметь возможность добавить проект в текущий проект. Потыкал по менюшкам поискал и не нашел, решил спросить людей совета.