Если тебя интересуют свежие сборки подходящего научного софта, то посмотри в сторону Gentoo. Д.ф.-м.н. Андрей Грозин (он поддерживает порты научных проектов gentoo) как бы рекомендует.
А так, по большому счёту — ставишь что угодно, туже Ubuntu и ставишь нужные тебе инструменты отдельно. Я вот всегда ставлю TeX Live и ROOT локально.