Давайте поможет Даше прочитать лог!

see the man page entry for --no-replay and --replay-window for more info or silence this warning with --mute-replay-warnings

А в чем причина?

Судя по количеству ошибок, настройки шифрования/аутентификации не совпадают на сервере и клиенте. Единичные такие сообщения обычно просто на убогий маршрут указывают, с убогими свитчами/роутерами, плодящими дубли.

Стоит ли это игнорировать? Чем это чревато?

Да прочитай же ты ман наконец. В таком количестве это явно приводит к деградации связи, я бы что-то сделать попытался.

Связь-то вообще есть?

Ты конечно уже проанализировал tcpdump и исключил вариант, когда пакеты именно дублируются?(как собственно и предполагается в сообщении об ошибке)

осиль уже ман по настройке openvpn, будь человеком