Как собрать 64-разрядную систему

Собрать кросс-тулчейнз и этим этим тулчейнзом собирать 64-хбитные бинарники.

Не мучайся и выкачай slamd64, если хочется слаки на 64-х битах.

я как юзер x86_64 LFS смотри сюда: http://www.linuxfromscratch.org/clfs/ думай головой (не все что там написано работает, например использовать multilib как написано там - не советую, лучше вначале собрать pure 64, а затем сделать кросс-{gcc,binutils,glibc} отдельно) и юзай последний glibc (у меня указанная у них версия не собралась)